При передаче товаров, подлежащих маркировке, в универсальном передаточном документе (УПД), кроме стандартной бухгалтерской информации о контрагентах, товаре, цене, количестве и пр..., должны фигурировать коды маркировки данных товаров.

Но все так просто - эти коды должны быть только в УПД в формате XML, в печатном PDF-файле их не должно быть.